先生愿意把自己毕生的精华心得都传授给学生,项目等3项成果获吉林省技术发明奖一等奖

 玩具模型     |      2020-03-14 06:18

  近期,物理学院黄胜友教授团队在蛋白质-多肽分子相互作用、核酸-核酸相互作用、蛋白质-蛋白质复合物结构的预测算法和应用等方面取得系列进展,相关成果在该领域国际权威期刊《核酸研究》上连中三元。

2017年度吉林省科学技术奖近日揭晓,吉林大学共有40项成果获奖,作为第一完成单位有35项成果获奖,包括一等奖11项,二等奖14项,三等奖10项。

人生有许多选择,但关键的就那么几步。令我深以为幸的是,在我的人生路上,能够遇到这样一位老师,一路指导我做出最正确的选择、走过最光明的人生路。

  5月9日,《核酸研究》在线刊发了黄胜友团队题为《HPEPDOCK: a web server for blind peptide–protein docking based on a hierarchical algorithm》的研究成果,该论文报道了一种基于分层式的蛋白质-多肽分子相互作用盲法预测新算法和在线预测平台,团队成员通过整合开发的快速多肽构象采样算法和集合对接模型,大幅提高了蛋白质-多肽相互作用复合物结构预测的效率和准确性。

在荣获一等奖的成果中,计算机科学与技术学院黄岚教授主持完成的“群智能优化算法基础及应用研究”项目、电子科学与工程学院卢革宇教授主持完成的“利用半导体氧化物纳米结构构筑高性能气体传感器的研究”项目、无机合成与制备化学国家重点实验室裘式纶教授主持完成的“多孔有机骨架材料及其衍生物的制备和性能研究”项目、中日联谊医院房学东教授主持完成的“消化系统肿瘤发病机制及基因治疗研究”项目、汽车仿真与控制国家重点实验室陈虹教授主持完成的“安全性约束下的车辆动力学预测与优化控制理论及方法”项目、地球科学学院许文良教授主持完成的“东北中生代构造-岩浆作用与区域成矿和找矿背景研究”项目、动物医学学院赖良学教授主持完成的“猪克隆与基因修饰技术创新及其在生物医药模型中的应用”项目等7项成果获吉林省自然科学奖一等奖。

老师既是学识渊博、具有开拓精神的学者,又是眼界开阔、具有战略思想的科学家。他就是国际上知名的气象学理论研究专家之一,中国气象界的泰斗级人物,也是兰州大学大气科学专业的创始人——中国科学院院士丑纪范先生。

  5月18日,《核酸研究》又刊发了题为《Determination of an effective scoring function for RNA–RNA interactions with a physics-based double-iterative method》的研究成果。团队成员提出了一套基于物理原理的双层迭代模型,通过内层迭代优化自由能函数的相互作用对势,在外层迭代中对诱导结构集进行更新,从而成功绕开了基于知识的自由能函数推导中“参考态”不可计算的难题,也克服了迭代学习过程中对诱导集的依赖,突破了传统方法中关于参考态的局限性,大幅提高了核酸相互作用能量函数的准确性。

建设工程学院孙友宏教授主持完成的“大陆深部科学钻探装备关键技术及应用”项目、材料科学与工程学院王慧远教授主持完成的“新型超塑性高强镁合金及制备关键技术”项目、生物与农业工程学院吴文福教授主持完成的“智能粮食干燥与储藏关键技术与装备”项目等3项成果获吉林省技术发明奖一等奖。

  1. 师恩如海 桃李深情

  5月26日,《核酸研究》再次刊发了黄胜友教授团队的最新研究成果《HSYMDOCK: a docking web server for predicting the structure of protein homo-oligomers with Cn or Dn symmetry》。团队成员发展了一套用于具有循环群和二面体群对称的蛋白质分子相互作用复合物结构快速预测算法和在线预测平台,为目前首个用于二面体群对称的蛋白质复合物结构预测在线开放平台。

地球科学学院单玄龙教授主持完成的“油砂资源成藏理论与勘探技术创新及目标优选”项目获吉林省科技进步奖一等奖。

1986年,我跟随丑纪范院士攻读大气科学博士学位,有幸成为先生招收的第一个博士研究生。更为荣幸的是,时至今日,我也能经常聆听恩师的教诲。

  据悉,蛋白质和核酸是构成生命体两类最重要的生物大分子,生命体的许多活动都由其相互作用来完成。因此,确定生命体中分子间的相互作用及其复合物结构,对于理解其相互作用机制和揭示疾病的发生发展机理有着重要意义。黄胜友是物理学院近年新引进的青年教师,为全国“百篇优秀博士论文奖”获得者,其团队主要聚焦于发展生物分子相互作用的预测算法及其应用的前沿研究。

据悉,2017年度吉林省自然科学奖共评选出一等奖13项,二等奖14项,三等奖17项;吉林省技术发明奖一等奖4项,二等奖4项,三等奖6项;吉林省科学技术进步奖一等奖17项,二等奖92项,三等奖117项。

还记得先生与我第一次见面,就长谈了3个小时。从个人经历、求学心得,再到写论文的方法、做学问的技巧,都无所保留的对我一一说来。 至今, 我还对先生第一次的谈话内容记忆犹新,这也成为日后我向学生们传授的第一课。再回想其实先生对每一位学生都是这样,真心真意爱护全身心投入的培养。先生愿意把自己毕生的精华心得都传授给学生,引导学生运用正确的思维方法,选择正确的科学道路,树立正确的人生理想,而这也正是他培育出那么多优秀气象事业人才的原因。

在教学中先生非常注重夯实学生的科研基本功,要求学生既有扎实的理论和实际研究的基础,又要勤动脑、 勤动手,充满活跃新颖的思想。 记得那时他要我一-方面为本科生指导毕业论文,另一-方面为研究生讲授部分动力气象课程。当时我并不理解先生的此番心思,只觉得自己对很多知识还“ 混混沌沌”。给学生指导论文的压力迫使我努力了解专业领域的最新进展,梳理研究思路方法; 而为了完成好先生提出的“.上课不看讲稿,公式现场推导”的要求,我只得细心备课,研习公式推导, 将大气动力学的基础知识牢固地记在心里,以免被先生当堂一针见血的地指出错误。而毕业后我明白了,正是先生这种独特的培养方式,促使我充分认识自己的不足,在点滴积累中,增长了讲授能力。

20世纪90年代, 我先后在加拿大和美国从事研究工作。 在此期间先生一直关心着我,在国外科研事业的发展。 记得有一年圣诞,我接到先生寄来的一-张贺卡,及随附的一封长达六页的书信。在书信中,先生悉数近年来国内大气科学发展,希望我能够“以国家需求为己任”, 回国发展。 2003年,我辞去了国外的工作,承师命回到母校兰州大学,参与筹建大气科学学院。在学院筹建初期先生倾注了大量的心血与精力。先生告诉我, 要一年一个台阶,一步一个脚印,除了继续数值天气预报研究外, 还要 “立足西北,走出自己的特色”。

依托西北地区得天独厚的自然环境,2005年, 兰州大学大气科学学院率先在海拔1966米的萃英山顶上建立起了我国第一个能够对云、气溶胶和陆气相互作用同时进行观测的半干旱气候与环境观测站。 时至今日,这座全球独一无二的观测站,已在研究解决我国黄土高原半干旱区气候与环境等问题的科学研究中发挥了无可比拟的作用,学院也在研究干旱半干旱气候,尤其在沙尘研究等方面,取得了一批具有创新意义和国际国内影响的标志性成果。回想起来,学院的每一步发展, 每一项成绩,无不得益于先生的关怀,印刻着先生的影响。

  1. 研风习雨 追沙捕尘

先生长期从事数值天气预报的基础理论和方法及其有关的大气和海洋动力学研究,他将数学、物理学、气象学等学科综合运用,对已有大气的观测资料在数值预报和数值模拟的使用方面作出了系统的创造性研究,提出了一系列令世界气象学界瞩目的新观点、新方法,并撰写了大量有重大科学价值的学术论文和专著。

在我看来,先生最杰出的贡献就是以创造性的理论开启了中国数值天气预报研究的自主创新之路。时至今日,这项研究成果依然为我国数值天气预报业务的发展发挥着巨大的指导作用。

先生曾用最浅显的语言,向我阐述了他在数值天气预报方面的构思,并指导我将统计与动力相结合的数值天气预报作为我博士论文的选题。先生说,过去的天气预报依赖于预报员的经验,在预报员的脑海中,天气形势的槽脊涨落,就是一张张连贯的天气图。而后的数值天气预报虽然取得了很大成绩,但存在一个根本性的缺陷,即所谓的处值问题。只使用一个时刻的资料,而忽略了长期历史资料的运用。如果统计学的方法和历史天气图应用进来,不只是用当时的天气图,而是可以像预报员一样把历史上的和近期的资料都用上,不是更好吗?针对这个问题,先生下了很大功夫,专门研究并思考如何克服。

经过刻苦钻研,先生于1962年完成了题为《天气数值预报中使用过去资料的问题》的著名论文,将数值预报问题由微积分方程定解问题转化为等价的泛函极值问题,提出了数值预报中使用前期观测资料的具体实现方法。就其核心实质而言,这是世界上最早关于四维同化的理论和方法,比国际上提出同一思想的时间要早10年。

此外,先生还通过证明大气温压场的连续演变和下垫面热状况的等价性,为充分利用已有的观测资料打下了理论基础。他进一步提出将古典初值问题改变为微积分方程反问题的新观点,将解反问题的理论应用到数值预报中来,提出用历史资料反求参数并使之与长期预报模式相匹配的创新型方法,率先建立了一个动力统计的季节预报模式,取得了巨大的科研成果。这些研究成果,不但具有极高的理论研究水平,而且对天气预报业务具有较强的实用价值和指导意义。